至2012年底，经过南岸区境内的轨交有重庆轨道交通3号线（运营中），重庆轨道交通6号线（运营中）。

　　重庆轨道交通3号线在南岸区境内站台有：铜元局站、工贸站、南坪站、四公里站、重庆工商大学站、六公里站、重庆交通大学站。